一、行政办公室（3个）

综合办、业务办、学工办 

二、系、室（11个）

生理学系、病理学系、病理生理学系、免疫学系、人体解剖学与神经生物学系、组织学与胚胎学系、医学微生物学系、法医学系、医学寄生虫学系、生物医学工程、医学超微结构研究室 

三、研究所（2个）

1.肿瘤研究所

2.生殖与干细胞工程研究所 

四、中心（3个）

1.基础医学实验教学中心（包括医学机能学实验室、医学形态学实验室、细胞与分子生物学实验室、大学生创新平台）

2.生殖健康研究中心

3.系统生物与数据信息研究中心